Protein–RNA interactions for Protein: Q9H300

PARL, Presenilins-associated rhomboid-like protein, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARLQ9H300 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PARLQ9H300 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PARLQ9H300 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms