Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NBPF3Q9H094 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NBPF3Q9H094 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms