Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0K3

ACTR3C, Actin-related protein 3C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR3CQ9C0K3 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TEX45-201ENST00000361664 1679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
ACTR3CQ9C0K3 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
ACTR3CQ9C0K3 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms