Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
BHLHE41Q9C0J9 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
BHLHE41Q9C0J9 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms