Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM5Q9C035 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM5Q9C035 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
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