Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GSDMCQ9BYG8 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GSDMCQ9BYG8 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms