Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY50

SEC11C, Signal peptidase complex catalytic subunit SEC11C, humanhuman

Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC11CQ9BY50 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 GCH1-205ENST00000536224 1805 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
SEC11CQ9BY50 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SEC11CQ9BY50 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18 ms