Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY49

PECR, Peroxisomal trans-2-enoyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PECRQ9BY49 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PECRQ9BY49 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PECRQ9BY49 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms