Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY41

HDAC8, Histone deacetylase 8, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC8Q9BY41 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
HDAC8Q9BY41 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms