Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW4

MAP1LC3C, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3C, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP1LC3CQ9BXW4 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
MAP1LC3CQ9BXW4 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms