Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT8

RNF17, RING finger protein 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF17Q9BXT8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
RNF17Q9BXT8 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RNF17Q9BXT8 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms