Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXT2

CACNG6, Voltage-dependent calcium channel gamma-6 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG6Q9BXT2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CACNG6Q9BXT2 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CACNG6Q9BXT2 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms