Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RAB11FIP5Q9BXF6 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms