Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVA0

KATNB1, Katanin p80 WD40 repeat-containing subunit B1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KATNB1Q9BVA0 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
KATNB1Q9BVA0 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
KATNB1Q9BVA0 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms