Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CRACR2AQ9BSW2 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CRACR2AQ9BSW2 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms