Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC30.51■■■□□ 2.48
FYCO1Q9BQS8 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
FYCO1Q9BQS8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC30.51■■■□□ 2.48
FYCO1Q9BQS8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
FYCO1Q9BQS8 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.48
FYCO1Q9BQS8 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
FYCO1Q9BQS8 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.51■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.45■■■□□ 2.47
FYCO1Q9BQS8 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC30.44■■■□□ 2.46
FYCO1Q9BQS8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms