Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARID3AQ99856 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms