Protein–RNA interactions for Protein: Q99720

SIGMAR1, Sigma non-opioid intracellular receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIGMAR1Q99720 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 WDR81-204ENST00000419248 3315 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SIGMAR1Q99720 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms