Protein–RNA interactions for Protein: Q99687

MEIS3, Homeobox protein Meis3, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3Q99687 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MEIS3Q99687 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MEIS3Q99687 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms