Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

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Length 562 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
ARXQ96QS3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
ARXQ96QS3 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
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