Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD8

SLC38A2, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A2Q96QD8 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC38A2Q96QD8 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms