Protein–RNA interactions for Protein: Q96MU7

YTHDC1, YTH domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDC1Q96MU7 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
YTHDC1Q96MU7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms