Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
FGD4Q96M96 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 POC1A-202ENST00000394970 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
FGD4Q96M96 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms