Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NEIL1Q96FI4 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms