Protein–RNA interactions for Protein: Q96FC9

DDX11, ATP-dependent DNA helicase DDX11, humanhuman

Predictions only

Length 970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX11Q96FC9 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
DDX11Q96FC9 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
DDX11Q96FC9 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms