Protein–RNA interactions for Protein: Q96F63

CCDC97, Coiled-coil domain-containing protein 97, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC97Q96F63 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CCDC97Q96F63 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms