Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX2

RNFT2, RING finger and transmembrane domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNFT2Q96EX2 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GJA3-201ENST00000241125 5211 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RNFT2Q96EX2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms