Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX7

TRIM44, Tripartite motif-containing protein 44, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM44Q96DX7 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ADPGK-AS1-201ENST00000563592 2730 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TRIM44Q96DX7 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TRIM44Q96DX7 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms