Protein–RNA interactions for Protein: Q96CE8

TM4SF18, Transmembrane 4 L6 family member 18, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF18Q96CE8 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
TM4SF18Q96CE8 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
TM4SF18Q96CE8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms