Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
FAM3DQ96BQ1 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
FAM3DQ96BQ1 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2742.5 ms