Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
TMIGD2Q96BF3 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
TMIGD2Q96BF3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms