Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWI1

LMO7, LIM domain only protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7Q8WWI1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMO7Q8WWI1 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMO7Q8WWI1 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms