Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DHRS3-204ENST00000616661 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SSH3Q8TE77 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms