Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHG7

SVIP, Small VCP/p97-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SVIPQ8NHG7 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 PIGO-202ENST00000361778 2464 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 OTOA-203ENST00000388957 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 DNAJB5-210ENST00000545841 3068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 VAT1-201ENST00000355653 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 CES1P1-201ENST00000421606 1704 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 FHDC1-202ENST00000511601 6583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 ACSM2A-202ENST00000396104 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 AC009084.2-201ENST00000624046 2810 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
SVIPQ8NHG7 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 RPL31-207ENST00000409711 2328 ntTSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 EGR2-201ENST00000242480 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 KATNAL1-202ENST00000380617 1634 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 TKT-203ENST00000423525 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 GNAO1-214ENST00000638705 3529 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 NFATC4-207ENST00000553469 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
SVIPQ8NHG7 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms