Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFT8

DNER, Delta and Notch-like epidermal growth factor-related receptor, humanhuman

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNERQ8NFT8 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 DERL1-203ENST00000419562 918 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
DNERQ8NFT8 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DNERQ8NFT8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms