Protein–RNA interactions for Protein: Q8NF99

ZNF397, Zinc finger protein 397, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF397Q8NF99 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ZNF397Q8NF99 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ZNF397Q8NF99 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms