Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ASNS-206ENST00000437628 1638 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
CARMIL3Q8ND23 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CARMIL3Q8ND23 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms