Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5Y2

MSL3, Male-specific lethal 3 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSL3Q8N5Y2 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MSL3Q8N5Y2 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms