Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VWA5B2Q8N398 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.7 ms