Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 GALNT16-202ENST00000448469 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LINC00518Q8N0U6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
LINC00518Q8N0U6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms