Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWF9

CCDC83, Coiled-coil domain-containing protein 83, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC83Q8IWF9 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCDC83Q8IWF9 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms