Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TREML4Q6UXN2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms