Protein–RNA interactions for Protein: Q6U841

SLC4A10, Sodium-driven chloride bicarbonate exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 1,118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A10Q6U841 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 CXCL3-201ENST00000296026 1075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC4A10Q6U841 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC4A10Q6U841 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms