Protein–RNA interactions for Protein: Q6PF15

KLHL35, Kelch-like protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL35Q6PF15 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLHL35Q6PF15 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 ANG-201ENST00000336811 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLHL35Q6PF15 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms