Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT1

ANKRD54, Ankyrin repeat domain-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD54Q6NXT1 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ANKRD54Q6NXT1 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ANKRD54Q6NXT1 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms