Protein–RNA interactions for Protein: Q6NX49

ZNF544, Zinc finger protein 544, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF544Q6NX49 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ZNF544Q6NX49 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms