Protein–RNA interactions for Protein: Q6NW40

RGMB, RGM domain family member B, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGMBQ6NW40 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
RGMBQ6NW40 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RGMBQ6NW40 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms