Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUQ1

RINT1, RAD50-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 792 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RINT1Q6NUQ1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RINT1Q6NUQ1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59 ms