Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
ATL3Q6DD88 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ATL3Q6DD88 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms