Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
SLC9A4Q6AI14 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SLC9A4Q6AI14 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms